Il a remporté plusieurs prix lors de concours internationaux d'orgue, notamment à Bruges, Speyer et à l'Orgelwettbewerb suisse. En 1997, il est nommé professeur d'orgue à la Hochschule für Musik de la Johannes Gutenberg-Universität de Mayence, où il est élu l'un des meilleurs professeurs. De 2012 à 2015, il a été organiste du Freiburger Münster. Il est sollicité à l'échelle internationale en tant qu'organiste interprète, membre de jury de concours et professeur invité pour des masterclasses. Gerhard Gnann enregistre souvent des CD pour des maisons de disques renommées et a reçu le prix ECHO Klassik, l'Oscar de l'industrie musicale allemande.