Gerhard Gnann studeerde orgel bij Ludwig Doerr, Ton Koopman, Ewald Kooiman en Guy Bovet. 

Hij won meerdere prijzen op internationale orgelwedstrijden, onder meer in Brugge, Speyer en de Zwitserse Orgelwettbewerb. In 1997 werd hij benoemd tot professor orgel aan de Hochschule für Musik van de Johannes Gutenberg-Universität in Mainz, waar hij verkozen werd tot een van de beste professoren. Van 2012 tot 2015 was hij organist van de Freiburger Münster. Hij wordt internationaal veel gevraagd als uitvoerend organist, jurylid bij wedstrijden, en als gastdocent voor masterclasses. Gerhard Gnann maakt vaak cd-opnames voor gekende platenlabels en werd bekroond met de ECHO Klassik prijs, de Oscar van de Duitse muziekindustrie.